中醫藥學是中華民族優秀傳統文化的重要組成部分，是我國醫學科學的特色，也是生命科學中具有自主創新優勢的領域。為了深刻揭示中醫藥理論內涵，發現新規律，實現自主創新，進一步提高中醫藥科技對臨床和生產實踐的支撐能力，更好地滿足人民群眾醫療保健的需求和實現小康社會目標的戰略需求，制定本綱要。
    一、指導思想和基本原則
    （一）指導思想
    堅持科學發展觀，堅持“自主創新、重點跨越、支撐發展、引領未來”的指導方針，遵循中醫藥自身發展規律，突出中醫藥特色和優勢，建立和完善中醫藥繼承與創新發展體系，以增進和維護人類健康為目的，加強中醫、中西醫結合、民族醫基礎研究、臨床研究和藥物研究，為提高中醫藥學術水平及防病治病能力，構建具有中國特色的醫療衛生保健體系，全面建設小康社會的戰略目標提供科技支撐。
    （二）基本原則
    1．繼承與創新相結合
    繼承中醫藥理論的科學內涵和豐富臨床經驗，保持和發揚中醫藥的特色和優勢；與時俱進，不斷發展，提出新思路，探索新方法，開展創新實踐，爭取新突破。
    2．基礎研究與臨床研究相結合
    以臨床療效為基礎，在臨床實踐中發現問題，總結規律，提出新觀點，開展基礎研究，促進基礎理論的發展與創新，用創新基礎理論指導臨床實踐的拓展與提高。
    3．中藥研究與中醫研究相結合
    重視中醫與中藥研究的整體性，以中醫理論為指導，結合臨床實踐開展中藥研究；中藥研究以提高療效、解決臨床用藥的新途徑、新方法及安全性等問題為目的，提高臨床服務能力。
    4．傳統方法與現代方法相結合
    遵循中醫藥自身發展規律，注重運用傳統方法和現代科學技術（包括現代醫學科學技術），加強跨學科、跨領域的交流與合作，研究解決中醫藥發展中的基本科學問題，促進可持續性發展。
    二、目標和任務
    （一）目標
    1．發展中醫理論
    系統整理和詮釋中醫、民族醫理論，總結現代研究成果，在思維模式、臟腑生理、病因病機、辨證治法、藥性理論、方劑配伍、中藥和針灸效應原理及現代臨床有效的其他非藥物療法的效應原理等方面取得創新與發展。
    到2010年，在中醫理論現代研究成果基礎上，形成專業術語統一，理論層次明確的基礎框架，運用現代科學理論和方法，探索其科學基礎，在中醫基礎理論、藥性理論、方劑配伍、中藥和針灸效應原理、骨傷手法機理等方面進行深入研究，努力創立新學說。
    到2020年，初步完成中醫理論的系統整理和詮釋，闡明理論的科學內涵，建立起由現象描述向本質闡明的中醫理論體系，為中醫臨床和中藥研發提供新的理論指導。 
    2．提高臨床療效
    進一步研究對重大疾病、常見病、多發病的有效診療方法和手段，科學評價中醫藥治療效果，優化診療方案，形成技術規范，豐富中醫、中西醫結合、民族醫診療思想、方法和技術，提高臨床療效。
    到2010年，進一步完善心腦血管疾病、糖尿病、惡性腫瘤、慢性呼吸系統疾病、腎病等若干重大慢性疾病中醫、中西醫結合防治方法的臨床療效評價和技術標準；形成療效確切、可推廣的具有中醫特色和優勢的防治方案或指南。
    到2020年，基本形成中醫藥防治重大疾病的系統理論和有效方法，為完善中醫臨床醫療體系和養生保健體系提供科技支撐。
    3．深化中藥研究
    進一步加強提高中藥的安全性、有效性及中藥質量的研究，建立符合中藥研究特點的現代化技術平臺，建立健全中藥不良反應監測方法和管理體系，大力推進中藥現代化、國際化，促進可持續發展。
    到2010年，進一步完善符合中藥特點的質量控制、藥效評價和安全評價方法；進一步查明我國中藥材資源概況，建立中藥資源的科學配置和合理利用規劃；建立中藥研制的關鍵技術平臺，創制若干治療心腦血管疾病、糖尿病、惡性腫瘤、病毒性肝炎、艾滋病、流感、骨質疏松癥等危害人類健康的疾病的有效新藥。
    到2020年，建立符合中醫效應特點的技術標準和評價體系，形成中藥自主創新體系；一批中藥新藥進入國際醫藥主流市場。
    （二）優先發展領域與重點任務
    1．基礎研究
    以中醫藥學術發展為重點，在實踐中進一步加強中醫藥繼承與創新，闡明相關理論的科學內涵，促進中醫藥理論和實踐的創新與發展，不斷豐富和完善中醫藥理論。
    ——中醫理論現代化研究成果的系統整理研究。分析、歸納并提煉近五十年中醫藥理論和臨床研究進展，總結規律，探索方法，不斷創新，豐富和發展中醫理論體系，以更好地指導臨床實踐。
    ——基本理論和概念的規范及詮釋研究。在文獻及現代科學研究基礎上，闡明中醫基本理論和概念的內涵與外延、邏輯關系及適用范圍，進一步推進中醫理論現代化。
    ——臟腑經絡理論研究。在中醫整體觀念指導下，探索臟腑功能作用特點和規律，深入揭示臟腑相互作用、相互制約、維持動態平衡的規律及調控機制，深化藏象理論及經絡學說的研究。指導臨床實踐，提高防病治病水平。
    ——病機與治法理論的研究。在常見病、疑難病的研究基礎上，選擇療效確切的疾病，進行以臨床為重點的系統研究，豐富病機與治法理論，形成治療新思路。
    ——證候與方劑相關性研究。開展以臨床為基礎的常見疾病證候特征的分析，進一步明確各種病證發生、發展、轉化的規律，探索方劑有效物質在多環節治療過程中的作用機理，豐富和完善方劑配伍理論。
    在“十一五”期間優先就以下領域開展研究：
    ——中醫臟象理論研究。
    ——經穴特異性及針灸治療機理研究。開展適合針灸療法的辨證方法和療效評價方法研究，探索針刺效應的機制和規律。
    ——中藥理論研究。以中醫基本理論為指導，進一步建立中藥理論研究的現代方法，進而揭示中藥藥性理論的科學內涵。
    ——中醫、民族醫文獻研究。以“古為今用”的目標，強調醫史文獻為當代的中醫學發展服務，繼續整理中醫歷代文獻，研究文獻可利用的途徑、方法，建立文獻數字化研究平臺，挖掘文獻數據，促進中醫理論的豐富和創新；加強民族醫藥文獻整理研究，促進民族醫藥理論與實踐的發展。
    2．臨床研究
    堅持中醫理論為指導，進一步豐富中醫藥診療思想、方法、技術，提高中醫藥防病治病能力。
    ——名老中醫藥專家學術傳承研究。應用現代信息科學技術與復雜科學的理論，整理名老中醫的學術思想、診療經驗；建立名老中醫藥專家學術傳承、研究以及推廣應用的新模式和有效方法。
    ——重大疾病的防治研究。以心腦血管疾病、糖尿病、惡性腫瘤等重大慢性病及艾滋病、病毒性肝炎等重大傳染病等為重點，開展中醫、中西醫結合防治方法和技術研究。針對突發公共衛生事件，總結和整理歷代相關文獻和近年經驗，發揮中醫藥對重大傳染病的辨證診治優勢，針    對可能引發突發公共衛生事件的疾病與因素，研究探索有效的中醫和中西醫結合的防治方法，建立綜合及應急防治方案。
    ——診療方案研究。選擇中醫藥治療有優勢的病種，集成臨床研究新成果，在病證結合的思路下，規范疾病的證候診斷，研究合理用藥，形成若干完整有效的治療方案。
    ——辨證規律研究。針對中醫取得可靠療效的常見病、多發病，開展疾病與證候相關研究，探索證候特征形成的病理基礎或演變規律，提出適宜于臨床診療需求的辨證方法。
    ——適宜技術挖掘與推廣研究。挖掘、遴選、整理、研究出一批應用基礎良好，臨床效果明確，經濟實用并具有傳統特色的診療技術，制定安全有效可控的技術操作規范，建立評價方法，開展推廣研究。
    ——評價方法研究。借鑒現代臨床研究的原理和方法，研究建立能夠體現中醫藥療效特點的評價方法和評價標準。
    ——積極開展中醫藥預防疾病研究和對亞健康的干預研究。系統整理研究相關文獻，挖掘整理創新中醫藥養生防病的理論和技術，并探索建立中醫亞健康治療體系與評價標準。
    在“十一五”期間優先就名老中醫藥專家學術傳承、重大疾病的防治、評價方法和適宜技術規范等方面開展研究。
        3．中藥研究
    遵循中醫藥理論，構建中藥研究的創新思維，促進中藥現代化。
    ——資源保護和可持續利用研究。開展資源調查及調查方法的研究；建立中藥資源監控和預警的相關技術；研究道地藥材、珍稀瀕危中藥材繁育技術和代用品。
    ——方法學研究。注重新方法、新技術在中藥研究中的合理應用，建立并完善符合中藥、民族藥特點的藥效及安全性評價方法、質量評價方法、藥材規范化生產技術方法學研究。
    ——共性技術研究。開展炮制、提取、制劑等中藥關鍵技術及裝備研究；研究中藥制藥新工藝、新技術、新劑型、新輔料。
    ——質量標準研究。研究中藥種子、飲片、配方顆粒、提取物、制劑質量標準和質量控制方法；闡明藥材道地性與藥效的科學原理，建立和完善質量控制方法及標準。
    “十一五”期間將優先就資源保護和可持續利用和質量標準開展研究。
    4．科普方法研究
    研究建立科學普及中醫藥知識的模式、方法和途徑，提高人民群眾對中醫藥的認知度。
        三、支撐條件和保障措施
    （一）多方籌措資金
    根據中醫藥科學研究需要，積極將中醫藥科學研究的重點內容納入國家各相關部門有關計劃、專項；建立激勵機制，鼓勵地方、企業和民間資金等多種渠道對中醫藥科學研究的支持。
    （二）組織科技隊伍
    適應中醫藥科學研究的需要，積極組織多學科的研究隊伍，培養中醫藥研究型人才，造就一批具有戰略思維和組織才干的中醫藥科研帶頭人和中醫藥科技創新團隊；促進科技體制改革，建立開放、流動、競爭、協作的機制，營造科學、民主、和諧的研究氛圍。
    （三）規范科技管理
    創新科技管理機制，提高科技活動的質量和效率。強調科學研究的頂層設計，強化對科技活動過程的引導、支持及監督管理，落實科技信用制度；規范評估行為，重視發揮專家咨詢作用；產學研緊密結合，促進科技成果向臨床和生產轉化。
    （四）加強條件建設
    建立臨床研究基地；規范實驗室管理；推動重點研究室、工程研究中心和中醫藥科技信息平臺建設；完善科技檔案管理，參與國家數據共享平臺建設；提高中醫藥研究能力。
    （五）推進國際合作
    將中醫藥科技合作納入政府間交流計劃，拓寬中醫藥合作領域；扶持聯合實驗室建設；支持國際間重大研究計劃的合作，積極學習、吸收、運用國際最新的科學技術成就和先進經驗，增強中醫藥創新能力。
    （六）保護知識產權
    健全科技項目知識產權管理制度，激勵和保護科研人員的創造性。加強中醫藥知識產權保護和利用，加深對中醫藥傳統知識保護的認識，不斷豐富保護手段，提高知識產權保護水平。